Cờ hiệu của Trường Khoa học liên ngành và Nghệ thuật, Đại học Quốc gia Hà Nội (VNU-SIS), là sự kết hợp hài hòa giữa các biểu tượng và màu sắc duy mỹ để phản ánh tầm nhìn, sứ mệnh và giá trị cốt lõi của Trường. Cờ hiệu được cấu thành từ bốn thành tố, ở vị trí trung tâm là logo của nhà trường, đặt trên ba dải màu xanh và cam chủ đạo.

Màu xanh tượng trưng cho trí tuệ, niềm hy vọng lạc quan, sự tin cậy và cảm hứng vô tận, phù hợp với tinh thần học thuật và môi trường giáo dục khai phóng của nhà trường. Đây cũng là gam màu của sự kết nối toàn cầu, thể hiện tầm nhìn chiến lược và uy tín học thuật mà VNU-SIS không ngừng theo đuổi. Trong khí đó, màu vàng cam biểu trưng cho sự sáng tạo, năng động và đổi mới, thể hiện tinh thần khởi nghiệp và sáng tạo của sinh viên lẫn giảng viên trong hệ sinh thái học thuật năng động của nhà trường.

Ba dải màu lần lượt đại diện cho ba trụ cột – ba lĩnh vực đào tạo và nghiên cứu liên ngành của trường, đó là:

1. Khoa học Xã hội Nhân văn và Nghệ thuật, thể hiện sự kết nối sâu sắc với các giá trị văn hóa, nhân văn và nghệ thuật, với truyền thống bắt nguồn từ 100 năm lịch sử Trường Mỹ thuật Đông Dương;
2. Quản trị, Kinh tế và luật pháp, biểu trưng cho khả năng lãnh đạo, quản lý - quản trị và hiểu biết pháp luật, chuẩn bị cho sinh viên hành trang vững vàng để thành công trong tương lai;
3. Khoa học tự nhiên và Công nghệ, tiên phong trong nghiên cứu khoa học, đổi mới công nghệ và khai phá các lĩnh vực khoa học tự nhiên hướng tới mục tiêu phát triển bền vững.

Xung quanh logo của Trường là vòng nguyệt quế được kết từ bông lúa - một biểu trưng cho mạch nguồn dân tộc Việt, kiên định vươn lên từ thổ nhưỡng đồng bằng. Vòng nguyệt quế này không chỉ biểu thị sự thành đạt và vinh quang trong học tập mà còn nhấn mạnh sự phong phú, đa dạng trong các chương trình đào tạo mà Trường cung cấp. Và không chỉ dừng lại ở 18 bông lúa - tượng trưng cho các ngành đào tạo Đại học và Sau đại học hiện hành của Trường, vòng nguyệt quế sẽ liên tục khơi mầm và trổ bông tạo ra những ngành học mũi nhọn mới đóng góp tích cực cho xã hội.

Năm ngôi sao trên logo đại diện cho cơ cấu tổ chức của trường, bao gồm Hiệu bộ và bốn khoa chính: Công nghiệp văn hóa và Di sản; Quản trị và Kinh tế sáng tạo; Kiến trúc, Đô thị và Khoa học bền vững; Nghệ thuật và Thiết kế. Các ngôi sao này tượng trưng cho sự đoàn kết, phối hợp chặt chẽ giữa các khoa và các phòng ban trong Trường, tạo nên một môi trường học tập và nghiên cứu chất lượng cao, mà mỗi cá nhân trong đó đều có cảm giác sâu sắc của sự thuộc về và lòng tự hào.

Con số 2002 đánh dấu mốc thành lập của VNU-SIS, nhưng phía sau là một con đường hơn 20 năm đầy nỗ lực và bứt phá, để phát triển trở thành một cơ sở đào tạo liên ngành như hiện nay. Đây đồng thời là một lời nhắc nhở về lịch sử hình thành và phát triển của nhà trường, thể hiện sự cam kết lâu dài đối với sự nghiệp giáo dục và đào tạo thế hệ tương lai.

Cờ hiệu VNU-SIS thêm khẳng định bản sắc riêng “tư duy liên ngành”, “tinh thần khai phóng” và “tầm nhìn toàn cầu” của Trường, nhằm hướng tới kiến tạo tương lai - phấn đấu, sáng tạo và phát triển để góp phần xây dựng một cộng đồng trí thức Việt vững mạnh cùng một xã hội thịnh vượng.